Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms