Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms