Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ID3Q02535 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ID3Q02535 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ID3Q02535 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ID3Q02535 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ID3Q02535 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ID3Q02535 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ID3Q02535 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms