Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms