Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms