Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX3P78415 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX3P78415 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX3P78415 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IRX3P78415 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms