Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms