Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms