Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR1AP61163 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms