Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CABP4P57796 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CABP4P57796 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABP4P57796 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABP4P57796 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms