Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1P56182 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1P56182 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1P56182 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1P56182 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1P56182 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1P56182 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1P56182 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1P56182 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1P56182 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1P56182 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1P56182 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms