Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNU13P55769 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNU13P55769 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNU13P55769 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNU13P55769 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNU13P55769 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNU13P55769 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNU13P55769 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNU13P55769 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNU13P55769 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNU13P55769 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNU13P55769 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms