Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP9P55211 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms