Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms