Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms