Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MVDP53602 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MVDP53602 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MVDP53602 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MVDP53602 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MVDP53602 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MVDP53602 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MVDP53602 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MVDP53602 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MVDP53602 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MVDP53602 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MVDP53602 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms