Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP98P52948 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP98P52948 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP98P52948 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP98P52948 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms