Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms