Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK2P49760 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLK2P49760 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK2P49760 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK2P49760 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms