Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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