Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms