Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD8P48556 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD8P48556 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms