Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTRNP46939 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTRNP46939 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms