Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPD2P43304 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPD2P43304 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPD2P43304 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPD2P43304 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPD2P43304 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPD2P43304 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPD2P43304 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPD2P43304 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPD2P43304 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPD2P43304 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPD2P43304 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPD2P43304 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPD2P43304 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPD2P43304 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms