Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF9P41273 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms