Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms