Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms