Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT2P35908 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms