Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RYKP34925 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RYKP34925 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RYKP34925 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RYKP34925 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RYKP34925 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RYKP34925 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RYKP34925 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYKP34925 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYKP34925 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RYKP34925 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RYKP34925 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms