Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND3P30281 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND3P30281 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND3P30281 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND3P30281 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND3P30281 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND3P30281 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND3P30281 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND3P30281 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND3P30281 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND3P30281 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND3P30281 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms