Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX2P28328 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX2P28328 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms