Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 CLASP2-217ENST00000486796 656 ntTSL 212.43□□□□□ -0.422e-16■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 WAC-AS1-201ENST00000527986 2323 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.73□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 SLC4A1AP-205ENST00000613517 819 ntTSL 512.52□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 MCPH1-205ENST00000521175 777 ntTSL 39.32□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 SLC4A1AP-202ENST00000427424 906 ntTSL 36.49□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 SPAG9-204ENST00000505173 2369 ntTSL 56.45□□□□□ -1.381e-18■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 SPAG9-219ENST00000514613 2523 ntTSL 26.39□□□□□ -1.391e-18■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 ECT2-212ENST00000444250 627 ntTSL 33.44□□□□□ -1.865e-7■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.341e-9■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.671e-9■■■■■ 31.8
PTBP1P26599 TSPO-205ENST00000472378 495 ntTSL 213.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 TSPO-204ENST00000428336 672 ntTSL 512.06□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 AFF4-209ENST00000491831 1667 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.489e-12■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CD69-204ENST00000543147 605 ntTSL 24.97□□□□□ -1.619e-12■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CD69-202ENST00000416624 962 ntTSL 24.26□□□□□ -1.739e-12■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.849e-12■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.432e-14■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PRPF4-202ENST00000374199 3212 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-14■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PRPF4-203ENST00000488937 567 ntTSL 33.22□□□□□ -1.892e-14■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 OPA1-207ENST00000392437 631 ntTSL 315.47■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 OPA1-209ENST00000419435 780 ntTSL 314.88□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 OPA1-206ENST00000392436 757 ntTSL 311.56□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 SDCCAG8-207ENST00000490065 699 ntTSL 411.48□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.193e-15■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-15■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.383e-15■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.543e-15■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-16■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CELF1-221ENST00000543178 576 ntTSL 47.48□□□□□ -1.211e-16■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CELF1-218ENST00000535982 549 ntTSL 47.18□□□□□ -1.261e-16■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CELF1-212ENST00000528538 581 ntTSL 46.83□□□□□ -1.321e-16■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CELF1-211ENST00000528434 543 ntTSL 54.98□□□□□ -1.611e-16■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CELF1-209ENST00000526277 556 ntTSL 44.9□□□□□ -1.631e-16■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 WDFY3-204ENST00000502713 425 ntTSL 318.74■□□□□ 0.595e-16■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 WDFY3-208ENST00000509172 453 ntTSL 313.87□□□□□ -0.195e-16■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 211.3□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PFKFB2-204ENST00000464777 523 ntTSL 312.71□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PFKFB2-203ENST00000411990 1876 ntTSL 29.07□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PFKFB2-208ENST00000545806 543 ntTSL 55.17□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 PFKFB2-210ENST00000618513 554 ntTSL 44.35□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-210ENST00000447414 575 ntTSL 414.76□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-204ENST00000413780 896 ntTSL 313.91□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-212ENST00000453729 703 ntTSL 1 (best)13.65□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-206ENST00000416420 2571 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-211ENST00000447875 754 ntTSL 1 (best)8.63□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-209ENST00000431815 568 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 THRB-205ENST00000415021 671 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CTDSPL2-209ENST00000560620 863 ntTSL 39.91□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.684e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.254e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 SPIN4-201ENST00000374884 4117 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.965e-36■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CCDC91-217ENST00000543809 1667 ntTSL 1 (best)5.42□□□□□ -1.549e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CCDC91-221ENST00000545737 1578 ntTSL 1 (best)4.64□□□□□ -1.679e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.99e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 CCDC91-210ENST00000540401 1439 ntTSL 1 (best)3.05□□□□□ -1.929e-7■■■■■ 31.7
PTBP1P26599 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.298e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.258e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.138e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 FAM49B-208ENST00000518344 554 ntTSL 314.31□□□□□ -0.122e-14■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.138e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 314.14□□□□□ -0.158e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 REXO5-212ENST00000566993 2549 ntTSL 514.01□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 513.44□□□□□ -0.268e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 213.2□□□□□ -0.38e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-244ENST00000637655 100 ntTSL 511.85□□□□□ -0.518e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 511.28□□□□□ -0.68e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-220ENST00000626216 558 ntTSL 310.76□□□□□ -0.698e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-230ENST00000636186 100 ntTSL 510.54□□□□□ -0.728e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.88e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-231ENST00000636376 100 ntTSL 59.16□□□□□ -0.948e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-215ENST00000492232 710 ntTSL 39.09□□□□□ -0.958e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-222ENST00000629417 882 ntTSL 38.87□□□□□ -0.998e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-245ENST00000637662 89 ntTSL 58.49□□□□□ -1.058e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-241ENST00000637335 86 ntTSL 58.13□□□□□ -1.118e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 AL590627.2-202ENST00000636318 138 ntTSL 57.66□□□□□ -1.188e-9■■■■■ 31.6
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 236.8 ms