Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMLP26374 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMLP26374 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMLP26374 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMLP26374 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMLP26374 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMLP26374 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMLP26374 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMLP26374 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMLP26374 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMLP26374 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMLP26374 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMLP26374 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMLP26374 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms