Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKBIAP25963 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms