Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYF6P23409 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms