Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCL3P20749 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCL3P20749 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCL3P20749 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCL3P20749 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCL3P20749 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCL3P20749 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCL3P20749 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCL3P20749 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCL3P20749 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCL3P20749 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCL3P20749 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCL3P20749 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCL3P20749 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCL3P20749 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCL3P20749 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms