Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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