Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GM2AP17900 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GM2AP17900 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GM2AP17900 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GM2AP17900 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GM2AP17900 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GM2AP17900 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GM2AP17900 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms