Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XBP1P17861 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XBP1P17861 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XBP1P17861 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
XBP1P17861 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XBP1P17861 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
XBP1P17861 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XBP1P17861 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms