Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms