Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms