Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms