Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XRCC5P13010 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC5P13010 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms