Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms