Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEFHP12036 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEFHP12036 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEFHP12036 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms