Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GZMBP10144 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms