Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms