Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP1P09874 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP1P09874 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP1P09874 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms