Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYMSP04818 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TYMSP04818 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TYMSP04818 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TYMSP04818 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms