Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-11P01762 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms